Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Pkp4Q68FH0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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