Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fnip1Q68FD7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms