Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Papd5Q68ED3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Papd5Q68ED3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms