Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Surf4Q64310 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms