Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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