Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms