Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpd52Q62393 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms