Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms