Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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