Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh1a2Q62148 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms