Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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