Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nell2Q61220 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms