Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
JrkQ60976 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
JrkQ60976 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms