Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms