Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms