Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms