Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms