Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SkiQ60698 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SkiQ60698 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms