Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms