Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms