Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5XFZ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5XFZ0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms