Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms