Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms