Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf3Q5HZG4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms