Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3558Q5FWC9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm3558Q5FWC9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm3558Q5FWC9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm3558Q5FWC9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm3558Q5FWC9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3558Q5FWC9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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