Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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