Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms