Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms