Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms