Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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