Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms