Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BB287469Q3UT53 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BB287469Q3UT53 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BB287469Q3UT53 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BB287469Q3UT53 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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BB287469Q3UT53 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BB287469Q3UT53 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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