Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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