Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc4Q3UP24 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms