Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms