Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms