Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms