Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms