Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U595 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Q3U595 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U595 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U595 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms