Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms