Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gse1Q3U3C9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms