Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam193bQ3U2K0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms