Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms