Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy4Q3TYX8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms