Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms