Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms