Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms