Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
H2afvQ3THW5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afvQ3THW5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms