Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prex2Q3LAC4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prex2Q3LAC4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms