Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl9Q32KG4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms